泌语新言68期丨【收藏贴】前列腺癌基因图谱及检测作用！

前列腺癌具有高度异质性，个性化治疗的快速发展对基因组图谱的需求愈加强烈。本文总结了局限性和晚期前列腺癌的分子突变，尤其强调了局限性前列腺癌的基因表达分析和晚期疾病的MSI分析。记得点击收藏！

转移性去势抵抗性前列腺癌基因图谱：CPCT-02队列的全基因组测序（WGS），包括197个转移性去势耐药PCas（mCRPC），结果显示，68%的病例可归为TCGA分类法提出的7个亚型，而且可治疗亚型HRD、MSI-H和CDK12-/-（串联重复基因型）与TCGA分子亚组无关。

对于局限性前列腺癌，建议对极低风险患者和大多数低风险前列腺癌患者进行主动监测。

五种基因表达检测方法：Decipher、Decipher PORTOS、Oncotype Dx Genomic Prostate Score (GPS)、Prolaris、ProMark。

NCCN指南建议使用Decipher 或者 Prolaris支持对中高危局部前列腺癌和至少10年的患者进行风险评估，对于低至有利的中度风险患者，允许使用3种检测(Decipher、 Prolaris、Oncotype DX Prostate)中的任何一种。

对于卵巢癌，Myriad Genetics MyChoice CDx是美国食品和药物管理局（FDA）批准的唯一一种用于评估HRD的检测方法。该方法计算了基因组不稳定性评分（GIS），考虑到全基因组杂合性缺失（LOH）、端粒等位基因失衡和大规模状态转换，评分≥42被归类为高HRD评分。此外，该方法检测BRCA1和BRCA2的变异和大的重排。

除此之外，其他检测HRD的方法学包括：Illumina TruSight Oncology 500 HRD结合靶向NGS（TruSight Oncology 500）和Myriad HRD检测，分析了 523个基因的单核苷酸变异、缺失、插入和拷贝数变异，以及55个基因的融合，也提供了MSI状态和TMB的信息。FoundationOneCDx分析提供了关于基因组LOH（gLOH）评分的信息，gLOH为16或更高被认为是“LOH高”。同源重组缺陷的分类器(CHORD) 是一种基于全基因组随机森林的方法，用于检测肿瘤染色体不稳定性。另一种有监督的学习算法-HRDetect, 是一种套索逻辑回归模型，用于识别乳腺癌肿瘤中的BRCA1和BRCA2突变特征。

据报道，4%-5%的mCRPC存在MMR基因突变。MSI状态可以通过经典地IHC评估：MLH1、MSH2、MSH6和PMS2蛋白，另一种策略是通过使用聚合酶链反应（PCR）对特定的微卫星（或串联重复序列）位点进行测序来评估MSI状态。在过去的几年里，NGS方法已经使多个微卫星位点的并行评估成为可能。各类评估方法见表1。

NCCN指南建议对有任何年龄确诊、从高危局部阶段开始的患者以及有家族前列腺癌病史的患者进行胚系检测。建议胚系Panel包括Lynch综合征相关基因MLH1、MSH2、MSH6和PMS2，以及HRD基因BRCA1、BRCA2、ATM、PALB2和CHEK2。其他基因，如HOXB13，也应该被考虑。

肿瘤分子分析在局限性PCa和mPCa的个性化临床管理和精确肿瘤治疗中的作用日益彰显。基因组风险分层可以为局限性前列腺癌的主动监测或强化治疗提供有力证据。对于mPCa，通过NGS评估HRD和MSI状态，对于预测靶向治疗的益处至关重要，如PARP抑制剂和免疫治疗。